Informacija

Po čemu je protein G dobio ime?

Po čemu je protein G dobio ime?


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Protein G (protein koji veže bakterijska protutijela) često se koristi za izvlačenje antitijela, na primjer u pokusima imunoprecipitacije kromatina (ChIP).

Međutim, nisam uspio pronaći web mjesto koje opisuje povijest spomenutog proteina i kako je nastalo ime proteina G, zbog činjenice da je slično nazvan (ali potpuno drugačiji) G protein bio veći u rezultatima pretraživanja.

Po čemu je protein G dobio ime? Na primjer, protein A dobio je ime po frakciji protutijela u kojoj je pronađen, a G protein je dobio ime jer je vezao BDP i GTP.


Kao što @canadianer spominje u svom komentaru, protein G je više nego vjerojatno dobio ime po ljudskoj skupini G soja streptokoka, G148.

Protein G, protein bakterijske stanične stijenke sa afinitetom za imunoglobulin G (IgG), izoliran je iz streptokoknog soja ljudske skupine G (G148).

Pročišćavanje i neka svojstva streptokoknog proteina G, novog reagensa koji veže IgG. - Björck et.al.

Protein G je protein streptokoka koji može vezati Fc dio proteina imunoglobulina G. Iako je sličan proteinu A, utvrđeno je da ima bolje afinitete vezanja za različite vrste konstantnih regija teških lanaca molekula IgG.

G dolazi iz Lancefieldove grupe. Lancefield grupiranje bila je metoda koja se koristila za klasifikaciju bakterija. Grupa G Streptokoke je moguće identificirati pomoću Lancefield seruma tipa G i tako su dobili svoju klasifikaciju.


Recenzije

A Muth, et al. Razvoj analoga Radamida kao inhibitora Grp94. Bioorg Med Chem. 2014lipanj

Evnouchidou I, i sur. ERAP1-ERAP2 Dimerizacija povećava učinkovitost rezanja peptida. J Imunol. 2014Lipnja193. (2): 901-8

K Xu, i sur. Sinteza AKAP3 posredovana je proteinima koji vežu RNA i signalizacijom PKA tijekom spermiogeneze miša. Biol Reprod. 2014Ožujka

Kapadia B., et al. ERK2-posredovana fosforilacija proteina koji veže transkripcijski koaktivator PIMT/NCoA6IP na Ser298 pojačava jetrenu glukoneogenezu. PLoS Jedan. 2013 178. prosinca (12): e83787.

Youker KA., Et al. Visok udio pacijenata s završnim stadijem srčanog zatajenja, bez obzira na etiologiju, pokazuje taloženje protukardijalnih antitijela u zatajenjem miokarda: humoralna aktivacija, potencijalni doprinos napredovanju bolesti. Eur Heart J. 2013 29. prosinca.

Bilichak A., et al. Potomci biljaka Arabidopsis thaliana izloženi soli pokazuju promjene u metilaciji DNA, modifikaciji histona i ekspresiji gena. PLoS Jedan. 2012 7 (1): e30515.

Y Kuroda., Et al. Poboljšana metoda kapilarne elektroforeze za analizu transferina s nedostatkom ugljikohidrata u ljudskom serumu, izbjegavajući smetnje komplementom C3. J Pharm Biomed Anal. 2013 Ožujka 2576: 81-6.

Dai C., et al. Gubitak supresora tumora Nf1 aktivira Hsf1 za promicanje karcinogeneze. J Clin Invest. 2012 Listopada 1122. (10): 3742-54.

Crystal Morales i sur. Drosophila Glikoprotein 93 je ortolog proteina toplinskog udara sisavaca gp96 (grp94, HSP90b1, HSPC4) i zadržava funkciju disperfinske veze neovisne pratilje za TLR-ove i integrirane. J Imunol. 2009 Listopada 15183 (8): 5121-8.


Protein G HP SpinTrap

Protein G HP SpinTrap je unaprijed zapakirana, jednokratna spin kolona koja sadrži Protein G Sepharose High Performance.

Odaberite model

Protein G HP SpinTrap je unaprijed zapakirana, jednokratna spin kolona koja sadrži Protein G Sepharose High Performance.

  • Za jednostavno, pročišćavanje antitijela u malim razmjerima ili obogaćivanje specifičnih proteina u prethodno zapakiranim spin kolonama koje su spremne za uporabu.
  • Klasični i unakrsni protokoli pružaju fleksibilnost.
  • Uvjeti ispiranja formatirani za tijekove rada elektroforeze i LC-MS analize.
  • Kinetika brzog vezivanja i veliki kapacitet osiguravaju veliki prinos.
  • Upakirano s proteinima G sefaroze visokih performansi za spajanje antitijela potklasa IgG.
  • Jednostavno povećanje s prethodno učvršćenim stupcima HiTrap Protein G HP.

Protein G Sefaroza HP ima veliki afinitet za Fc regiju IgG različitih vrsta. Dvije opcije u protokolu obogaćivanja proteina dopuštaju da se vezani antigen eluira odvojeno (protokol umrežene veze) ili zajedno s antitijelom (klasični protokol).

Postoji i protokol za učinkovito, malo pročišćavanje monoklonskih i poliklonskih protutijela iz seruma i supernatanata stanične kulture za manje od 20 minuta. Nije potrebna prethodna obrada uzorka.

Za veće opsege molimo koristite Protein G HP MultiTrap i HiTrap Protein G HP


Proteini A, G i A/G MagBeads

GenScript Protein A, G i A/G MagBeads razvijeni su za brzo, prikladno i reproducirajuće imunoprecipitacija (IP) i pročišćavanje imunoglobulina u malim razmjerima. Kovalentno unaprijed povezujući rekombinantne proteine ​​A, G i A/G s površinom superparamagnetskih kuglica, ove MagBeads korisnicima pružaju jednostavne, jednostavne i vremenske postupke za imunomagnetsko odvajanje.

Zbog eliminacije domena koje se ne vezuju za IgG i drugih nepoznatih fragmenata funkcija, rekombinantni proteini A, G i A/G pokazuju visok afinitet prema podrazredima IgG mnogih vrsta, uključujući čovjeka, zeca i miša itd. To omogućuje pročišćavanje IgG iz supernatanata stanične kulture, seruma i ascitesa ili drugih početnih uzoraka. Osim toga, proteini A, G i A/G MagBeads također se mogu koristiti za imunoprecipitaciju ciljnih proteina iz sirovih uzoraka pomoću odabranog primarnog antitijela. Da bi se spriječila koelucija antitijela, potrebno je kemijski umrežiti antitijelo s kuglicama obloženim proteinima A, G i A/G prije koraka imunoprecipitacije. Čitaj više "

Primjenom tehnologije magnetskog odvajanja, proteini A, G i A/G MagBeads opskrbljuju istraživače brzim, lakim i učinkovitim postupcima IP/izolacije. Za korištenje MagBeads -a također je potreban magnetski stalak za odvajanje. Svi se koraci odvijaju u jednoj cijevi, bez potrebe za stupovima, centrifugiranjem ili prethodnom obradom. Izuzetno nježno magnetsko rukovanje sprječava gubitak ciljanih IgG -a ili proteina i održava ih netaknutima tijekom cijelog postupka. Proteini A, G i G/G MagBeads savršeni su alati za imunoprecipitaciju i pročišćavanje manjih IgG.

Tablica 1. Svojstva rekombinantnog proteina A, G i L na smolama

Protein A Protein A
MagBeads MX
Protein G Protein G
MagBeads MX
Proteini A/G
Izvor Staphylococcus aureus Staphylococcus aureus Streptococcus Streptococcus
Molekularna težina 34 kDa 34 kDa ≈22 kDa ≈22 kDa 43 kDa
Brojevi mjesta vezivanja IgG (Ig) 5 5 3 3 4 proteina A i 2 proteina G
IgG Kapacitet vezivanja 10 mg zečjeg IgG po ml taloženih kuglica ≧ 30 mg humanog IgG po ml taloženih kuglica 10 mg kozjeg IgG po ml taloženih zrna ≧ 25 mg humanog IgG po ml taloženih kuglica 10 mg kozjeg IgG po ml taloženih zrna
Mačka NO. L00273 L006724 L00274 L006734 L00277

Ulica M, Standard za molekularnu težinu proteina.
Traka 1, Protok zečjeg seruma.
Traka 2, Pročišćeni zečji IgG iz seruma.
Traka 3, Bakterijski lizat koji eksprimira protein označen His.
Traka 4, Imunoprecipitirani protein obilježen His-om, 32 kDa (Anti-His antitijelo umreženo s MagBeads).

Sl.2. Pročišćavanje zečjeg IgG iz zečjeg seruma i imunoprecipitacija proteina označenog Hisom iz bakterijskog lizata pomoću GenScript proteina A MagBeads.

  • Poluautomatski sustav za magnetsko odvajanje:Skratite vrijeme pročišćavanja proteina i antitijela.
  • MagBeads obložene epitop oznakom antitijela: Imunoprecipitacija i brza izolacija označenih proteina.
  • Magnetski odvajajući regali:dobro osmišljen i izvediv uređaj u tehnologiji biomagnetskog odvajanja.

Citati

  • Tradtrantip L., i sur. Terapeutsko cijepanje autoantitijela Anti-Aquaporin-4 u Neuromyelitis Optica pomoću IgG-selektivne proteinaze. Mol Pharmacol.2013 Lipnja 83 (6): 1268-75.
  • Song SE., Et al. IGFBP5 posreduje visokom glukozom induciranom aktivacijom srčanih fibroblasta. J Mol Endocrinol.2013 Travnja 1250. (3): 291-303.
  • Dong DJ., Et al. Steroidni hormon 20-hidroksiekdizon regulacija fosforilacije receptora lipoproteina vrlo visoke gustoće (VHDL) za apsorpciju VHDL. Biochem insekata Mol Biol.2013 Travnja 43 (4): 328-35.
  • Yin Y., et al. Diferencijalno eksprimirani geni ljudskih mikrovaskularnih endotelnih stanica kao odgovor na antitijela NS1 protiv virusa dengue supresijskom suptraktivnom hibridizacijom. Virusni imunol.2013 26. lipnja (3): 185-91.
  • Jennings VA., Et al. Ubojica i prijenos dendritičkih stanica aktiviranih limfokinom pojačava onkolitičku reovirusnu terapiju za rak jajnika prevladavajući neutraliziranje antitijela u ascitesu. Int J Rak.2014 Ožujka1134 (5): 1091-101.
  • Hwang JH., Et al. Izoforme proteinske fosfataze 2A pomoću skela Aβ reguliraju diferencijaciju putem kontrole Akt. J Biol Chem.2013 Studenog 1288. (44): 32064-73.
  • Lan JF., Et al.Prohibitin stupa u interakciju s proteinima ovojnice virusa sindroma bijele pjege i sprječava infekciju u crvenih močvarnih rakova Procambarus clarkii. J Virol.2013 Prosinca87 (23): 12756-65.
  • Asavapanumas N. i sur. Jedinstvena patologija neuromijelitisa optike proizvedena u naivnih štakora intracerebralnom primjenom NMO-IgG. Acta Neuropathol.2013 5. studenog.
  • Liu W. i sur. Hormonski ovisna funkcija Hsp90 u preslušavanju između signalnih putova 20-hidroksiekdisona i juvenilnih hormona u kukaca određena je diferencijalnom fosforilacijom i interakcijama proteina. Biochim Biophys Acta.2013 Studeni 1830. (11): 5184-92.
  • Mabashi-Asazuma H., et al. Novi bakulovirusni vektor za proizvodnju ne-fukoziliranih rekombinantnih glikoproteina u stanicama insekata.Glikobiologija.2013 9. prosinca.
  • XW Wang i sur. Lektin C-tipa veže se na β-integrin kako bi potaknuo hemocitnu fagocitozu kod beskičmenjaka. J Biol Chem.2013 9. prosinca.
  • Tubon TC Jr., et al. dCREB2 posredovano poboljšanje formiranja memorije.J Neurosci.2013 Travanj 2433 (17): 7475-87.
  • Kratki KR., Et al. Protutijela posreduju u stvaranju neutrofilnih izvanstaničnih zamki (NET) u srednjem uhu i olakšavaju sekundarni pneumokokni otitis media. Infektni imunitet.2014 Siječnja82 (1): 364-70.
  • Armistead JS., Et al. Protutijela na jedan, očuvani epitop u Anopheles APN1 inhibiraju univerzalni prijenos falciparum i vivax malarije. Infektni imunitet.20139. prosinca.
  • Zhang D., et al. Generiranje i karakterizacija novog rekombinantnog antitijela protiv LMP1-TES1 Epstein-Barr virusa izoliranog pomoću faznog zaslona. Virusi.2013 225. travnja (4): 1131-42.
  • De Oliveira SN., Et al. Fuzijski protein CD19/Fc za detekciju receptora himernih antigena anti-CD19. J Transl Med.2013 Siječnja 2911: 23.
  • Safdari Y., et al. humMR1, visoko specifično humanizirano jednolančano antitijelo za ciljanje EGFRvIII. Int Immunopharmacol.2013 Prosinca 2518 (2): 304-310.
  • Lin H., et al.Novo ljudsko Fab antitijelo za Trop2 inhibira rast raka dojke in vitro i in vivo.Int J Rak.2014 Ožujka 1134. (5): 1239-49.

Označene smole za pročišćavanje proteina: pročišćavanje proteina označenih polihistidinom, GST, biotinom i streptavidinom.


Stupac proteina G za pročišćavanje antitijela opće namjene

Kolone HiTrap Protein G HP unaprijed su zapakirane smolom visokih performansi Protein G Sepharose. Ova smola sa afinitetom prema proteinu G dobar je prvi izbor za hvatanje antitijela opće namjene u laboratorijskim razmjerima, jer se veže na širi raspon IgG od eukariotskih vrsta, a također se veže za više podklasa IgG nego smole na bazi proteina A.

Koristite ove stupce za pročišćavanje IgG -a iz krava, ovaca, konja, štakora, miša i ljudi, uključujući ascites, serum i supernatante stanične kulture.

Kolone HiTrap Protein G HP isporučuju pročišćavanje visokih performansi visoke razlučivosti s kapacitetom vezanja od 25 mg smole IgG/mL i brzom kinetikom. Kolone su stabilne u širokom rasponu pH - radni pH 3 do 9 i pH 2 do 10 za čišćenje.


Što je protein A?

Protein A definiran je kao površinski protein veličine 42 kDa. Protein A izvorno se nalazi u staničnoj stjenci Staphylococcus aureus. Kodiran je "spa" genom. Protein A reguliran je DNK topologijom, staničnom osmolarnošću i dvokomponentnim sustavom. Ovaj mikrobni rekombinantni protein visoko je uključen u biokemijske reakcije zbog svoje sposobnosti vezanja s nekoliko vrsta antitijela kao što su IgG, IgA, IgE i IgM. Dakle, ovaj mikrobni protein koristi se za pročišćavanje tipova ljudskih antitijela. Ima pet homolognih "Ig" veznih domena koje se presavijaju u snopove s tri spirale. Svaka se domena može vezati za proteine ​​imunoglobulina iz mnogih vrsta sisavaca, ponajviše s antitijelima IgG. Protein A se specifično veže za teški lanac Fc regije većine imunoglobulina.

S obzirom na proteine ​​ljudske obitelji VH3, protein A veže se na Fab regiju. Rekombinantni protein A je širi po svojoj sposobnosti vezanja na druga ljudska antitijela (IgA, IgE, IgM) osim IgG antitijela. No, slaba je ponuda s ljudskim IgG -om3 potklase i ne veže se s IgD ljudskim antitijelom. Protein A također se može vezati za IgG antitijela drugih vrsta, poput konja, zeca, miša, psa, majmuna, krave itd.

Slika 01: Protein A

Protein A igra ključnu ulogu u Staphylococcus aureus patogeneza. Ovaj protein olakšava vezanje bakterija na površinu obloženu Von – Willebrandovim faktorom. Dakle, povećava učinkovitost bakterijske infekcije. Protein A također osakaćuje ljudski humoralni imunitet. Ovaj mikrobni rekombinantni protein proizvodi se industrijskim procesom fermentacije.


Domene i ponavljanja

Tipka značajkePozicija (i)Opis Radnje Grafički prikazDuljina
& ltp> Ovaj pododsjek odjeljka & lta href = "http://www.uniprot.org/help/family%5Fand%5Fdomains%5Fsection"> Obitelj i domene & lt/a> opisuje položaj i vrstu domene koja je definirana kao specifična kombinacija sekundarnih struktura organiziranih u karakterističnu trodimenzionalnu strukturu ili preklop. & ltp> & lta href = '/help/domain' target = '_ top'> Više. & lt/a> & lt/p> Domena i 3 – 46 IgG_binding_B InterPro napomena

& ltp> Podaci koje je generirao UniProtKB sustav automatskih oznaka, bez ručne provjere. & lt/p> & ltp> & lta href = "/manual/evidences#ECO: 0000259"> Više. & lt/a> & lt/p> Automatska tvrdnja izvedena iz podudaranja potpisa i

Automatska tvrdnja izvedena iz podudaranja potpisa i

Automatska tvrdnja izvedena iz podudaranja potpisa i

Obiteljske i domenske baze podataka

Integrirani izvor proteinskih obitelji, domena i funkcionalnih mjesta

Baza podataka domene proteina Pfam


Obrada molekula

Tipka značajkePozicija (i)Opis Radnje Grafički prikazDuljina
& ltp> Ovaj pododjeljak odjeljka 'PTM/Obrada' opisuje opseg polipeptidnog lanca u zrelom proteinu nakon obrade ili proteolitičkog cijepanja. & ltp> & lta href = '/help/chain' target = '_ top'> Više. & lt/a> & lt/p> Lanac i PRO_0000127700 1 – 340 Protein koji veže gvanin nukleotid G (I)/G (S)/G (T) podjedinica beta-3 Dodaj BLAST 340

Proteomske baze podataka

jPOST - Japan Proteome Standard Repository/Database

MaxQB - MaxQuant baza podataka

PaxDb, baza podataka o prosječnim količinama proteina u sve tri domene života

Baza podataka PRoteomics IDEntifications

ProteomicsDB: resurs proteoma više organizama

PTM baze podataka

iPTMnet integrirani resurs za PTM u kontekstu biologije sustava

Sveobuhvatni izvor za proučavanje proteinskih post-translacijskih modifikacija (PTM) kod ljudi, miševa i štakora.


Interakcije izvan mjesta za kombiniranje antigena

B. STREPTOKOKALNI PROTEIN G

Streptokokni protein G je protein stanične stjenke s izvanstaničnim dijelom koji se sastoji od dvije (ili tri) male domene koje vežu serumski albumin (GA domene) i dvije (ili tri) domene koje vežu imunoglobulin (B domene). Prema NMR spektroskopiji i rendgenskim kristalografskim studijama, domene B sastavljene su od središnje α-spirale nabijene na četiri lanca β-lista (Gronenborn i Clore, 1993 Sauer-Eriksson et al., 1995.). Konstante ravnoteže reakcije između proteina G i IgG čovjeka, kunića, miša i koze kreću se između 10 10 M -1 i 10 10 M -1, što je više od odgovarajućih vrijednosti za vezanje proteina A (Åckerström i Björck, 1986 ). Vezanje proteina G optimalno je pri pH 4–5, dok je optimalno za vezanje proteina A pri pH 8,0.

Sve četiri potklase humanog IgG međusobno komuniciraju s proteinom G s visokim afinitetom (Tablica 22). Protein G veže se za Fc, kao i za dijelove Fab. Međutim, interakcije između proteina G i Fab mnogo su slabije od interakcije s Fc. Neki imunoglobulini stupaju u interakciju s proteinom G pretežno putem Fab -a, poput mišjeg IgG1, dok drugi vežu protein G prvenstveno pomoću Fc, poput ljudskog IgG (Lian et al., 1994.). Fab humanog IgG2 ne može reagirati s proteinom G (Perosa et al., 1997 ).

Interakcije između proteina G i regija Fab i Fc proučavane su NMR-om i rendgenskom kristalografijom (Derrick i Wrigley, 1994 Sauer-Eriksson et al., 1995. Lian et al., 1994. Kato et al., 1994.). Mjesto vezanja Fc za B domenu nalazi se u rascjepu između CH2 i CH3 domene, slično mjestu vezanja koje koristi protein A (slika 79). Tri ostatka CH2 i četiri ostatka CH3 su uključene u međufazne interakcije. Osam ostataka B domene koja veže imunoglobulin, uključujući pet ostataka iz α-spirale, doprinosi sučelju. Iako se mjesta vezivanja Fc za protein G i protein A uvelike preklapaju, načini interakcija su u oba slučaja prilično različiti. Proteinski kompleks G-Fc uglavnom uključuje nabijene i polarne kontakte: protein G ima 12 polarnih ili nabijenih interakcija s Fc i nema hidrofobnih kontakata. Proteini A i Fc kontakti stabiliziraju se uglavnom nespecifičnim hidrofobnim interakcijama. Između proteina A i Fc dolazi do pet hidrofobnih kontakata, ali samo šest polarnih interakcija.

B domena proteina G koristi različite, nepreklapajuće dijelove za vezanje na Fab i Fc. Drugi β-niz B domene veže se za Fab, tvoreći antiparalelni β-list sa sedmim β-nizom iz CH1 domene, uključujući ostatke od Ser-209 do Lys-216 (slika 80). Osim toga, postoji drugi manji kontakt između α-spirale B domene s prvim β-lancem u CH1 (ostaci Pro-125 do Tyr-129). Oba kontakta tvore opsežnu površinu vezanja između B domene i Fab, koja je veličine usporediva s mjestima interakcije antitijelo-antigen. Kontaktni dio Fab je visoko očuvan između različitih podklasa i vrsta, a takva strategija vezanja proteina G minimizira učinke varijabilnosti sekvence na imunoglobulin. Nisu pronađene velike promjene u konformaciji niti u jednom proteinu pri nastanku kompleksa.

SLIKA 80. Interakcija proteina G domene III s CH1 domena mišjeg Fab fragmenta.

(Derrick i Wrigley, 1992. Preštampano uz dopuštenje.) Autorska prava © 1992


Gledaj video: GASTTOZZ X TOZLA - KO TI JE TATA? OFFICIAL VIDEO (Svibanj 2022).