Informacija

3.1: Protokol proteina škroba - Biologija

3.1: Protokol proteina škroba - Biologija


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

U ovoj ćete aktivnosti istražiti koje vrste hrane sadrže škrob, a koje vrste proteina. Prvo ćete morati na neki način testirati škrob i bjelančevine.

1. dio: Koja se indikatorska rješenja mogu koristiti za ispitivanje škroba i proteina?

Otopina indikatora dobar je test za škrob ako promijeni boju u prisutnosti škroba, ali ne pokaže istu promjenu boje u prisutnosti drugih molekula, poput bjelančevina, lipida ili šećera. Dobit ćete dvije otopine pokazatelja kako biste procijenili može li se bilo koja od ovih otopina indikatora upotrijebiti za ispitivanje škroba. Također ćete procijeniti može li se bilo koja od ovih otopina indikatora upotrijebiti za ispitivanje bjelančevina.

The pribor imat ćete na raspolaganju za testiranje rješenja pokazatelja:

  • Rješenje pokazatelja 1
  • Rješenje pokazatelja 2
  • Kontejneri za testiranje, plus marker i maskirna traka za označavanje ovih spremnika
  • Miješalice; rukavice
  • Uzorci koje možete koristiti za testiranje rješenja pokazatelja:
    • Kukuruzni škrob
    • Saharoza = stolni šećer
    • Želatina (protein iz kostiju, kože itd. Domaćih životinja)
    • Biljno ulje
    • Krumpirov škrob
    • Voda
    • Bjelanjke u prahu (bogato proteinima)

1. Popunite ovu tablicu.

Rješenje pokazatelja za koje je dobar test protein će promijeniti boju kada se ovim uzorcima doda s gornjeg popisa:

Rješenje pokazatelja za koje je dobar test protein htjeti ne promijeniti boju kada se ovim uzorcima doda s gornjeg popisa:

Do postupci projektiranja za ispitivanje je li svaka otopina pokazatelja dobar test za škrob ili za proteine, odgovorite na pitanja 2 i 3. Budite konkretni.

2. Koji ćete od gore navedenih uzoraka koristiti za ispitivanje svake otopine pokazatelja? Objasnite svoje razloge za uključivanje ili isključivanje svakog uzorka na gornji popis.

3. Kako ćete ocijeniti svaki test? Što ćete tražiti?

4. Pretpostavimo da su dvije grupe dodijeljene za testiranje istog pokazatelja s istim uzorkom, ali prva skupina izvještava o promjeni boje, a druga ne. Kako se to moglo dogoditi?

Da biste bili sigurni u svoje rezultate, morat ćete pažljivo provesti svaki test i imati ponovljene testove (tj. Da dvije skupine provedu svaki test). Bit će potreban veliki broj testova kako bi se procijenilo može li se bilo koja otopina indikatora upotrijebiti za ispitivanje škroba ili proteina. Vaš će učitelj voditi raspravu kako bi se dogovorio o razrednom postupku, a zatim dodijeliti posebne testove svakoj učeničkoj skupini. Prije nego započnete s ispitivanjima, pročitajte upozorenja i donje upute.

Oprez

  • Čini ne dodaj oboje indikatorska rješenja za isti uzorak; upotrijebite svaku otopinu pokazatelja na drugom uzorku u zasebnom spremniku.
  • Budite oprezni pri rukovanju otopinom indikatora 1; može zaprljati ruke i odjeću.
  • Otopina indikatora 2 sadrži natrijev hidroksid, jaku bazu. Budite vrlo oprezni ne prskati niti prolijevati. Ako poprskate bilo koju otopinu indikatora na sebe, odmah je isperite vodom. Nazovite svog učitelja za pomoć.
  • Nositi rukavice da biste se zaštitili.

5. Ispunite sljedeću tablicu kako biste zabilježili podatke za testove dodijeljene vašoj grupi.

Uzorak*

Rješenje pokazatelja

(1 ili 2)#

Boja otopine pokazatelja nakon dodavanja uzorku

Je li otopina indikatora promijenila boju? (Da ili ne)

Bilješka

* Za bilo koju vrstu škroba, bjelanjke u prahu ili saharozu, otopite oko 1/2 mL uzorka u oko 2 mL vode. Za želatinu, otopite do 1/4 ml u oko 2 ml vode. Za ulje i vodu upotrijebite oko 1 ml kao uzorak.

# Koristiti otopina indikatora 1, dodati do 5 kapi do uzorka i promiješajte. Koristiti otopina indikatora 2, dodati do 20 kapi do uzorka i promiješajte. S bilo kojom otopinom indikatora možete prestati čim primijetite promjenu boje u otopini indikatora. S otopinom indikatora 2, promjena boje može potrajati i do minute.

6. Upotrijebite podatke svih studentskih skupina da biste popunili sljedeću tablicu.

Uzorak

Je li rješenje Indikator 1 promijenilo boju?

Je li rješenje Indikator 2 promijenilo boju?

Ponovi 1

Ponovite 2

Ponovi 1

Ponovite 2

Kukuruzni škrob

Krumpirov škrob

Bjelanjke u prahu

Želatina

Saharoza

Biljno ulje

Voda

Ako postoje razlike između ponavljanja bilo kojeg testa, vaš razred će raspravljati o mogućim razlozima za te razlike. Da biste dobili konačan rezultat, vjerojatno će vam trebati dodatni test ponavljanja primjenom najbolje metodologije.

7. Je li bilo koje pokazateljsko rješenje dobar test za škrob? Ako da, koji?

Ukratko sažmite dokaze koji idu u prilog vašem zaključku.

Koji bi vam dodatni dokazi pomogli da budete sigurni u svoj zaključak?

8. Je li bilo koje pokazateljsko rješenje dobar test za protein? Ako da, koji?

Ukratko sažmite dokaze koji idu u prilog vašem zaključku.

Koji bi vam dodatni dokazi pomogli da budete sigurni u svoj zaključak?

2. dio: Koje vrste hrane sadrže škrob? Koje vrste hrane sadrže proteine?

U ovom dijelu aktivnosti procijenit ćete nalaze li se škrob i proteini

  • Sva hrana dobivena od životinja ili neka hrana dobivena od životinja
  • Sva hrana dobivena iz biljaka ili neka hrana dobivena iz biljaka
  • Sva hrana dobivena od životinja ili biljaka ili neka hrana dobivena od životinja ili biljaka

9. Započnite kategoriziranjem rezultata iz 1. dijela u donjoj tablici.

Hrana dobivena iz životinjama

Je li ova hrana imala škrob?

Je li ova hrana imala proteine?

Hrana dobivena iz bilje

Je li ova hrana imala škrob?

Je li ova hrana imala proteine?

10. Iskoristite rezultate sažete u pitanju 9 da napišete hipotezu o tome koje vrste hrane sadrže škrob (sve ili neke namirnice životinja i/ili biljaka).

Pomoću rezultata napišite hipotezu o tome koje vrste hrane sadrže protein.

11. Dobit ćete dolje navedene namirnice kako biste provjerili svoje hipoteze. Ispunite stupce 2-4 u ovoj tablici kako biste predvidjeli očekivane rezultate; ako vaše hipoteze ne predviđaju određeni rezultat, stavite a?.

Hrana

(s uputama za pripremu uzorka za ispitivanje)

Dolazi li ova hrana od biljaka ili životinja?

Na temelju vaših hipoteza, očekujete li da ova hrana sadrži:

Na temelju rezultata razreda, sadrži li ova hrana:

Škrob?

Protein?

Škrob?

Protein?

Grah (2 graha zgnječite u pastu)

Maslac (~ 1 ml)

Žele (pomiješajte ~ 1 mL s ~ ​​½ mL vode)

Kruh (mrviti ~ 1 mL; dodati ~ ½ mL vode)

Jogurt (~ 1 ml)

12. Da biste ocijenili svoje hipoteze (pitanje 10), morat ćete testirati svoja predviđanja (pitanje 11). Ukratko opišite kako će vaš razred testirati ta predviđanja.

Bit će potreban veliki broj testova, pa će vaš učitelj dodijeliti posebne testove svakoj učeničkoj skupini. Zapišite podatke prema uputama učitelja. Zatim zabilježite podatke razreda u posljednja dva stupca tablice u pitanju 11 i odgovorite na pitanja 13 i 14.

13. Je li vaša hipoteza o tome koje vrste hrane sadrže škrob podržani novim podacima? Objasnite kako dokazi podržavaju ili ne podupiru vašu hipotezu.

Ako vaša hipoteza nije podržana, napišite novu hipotezu koja uzima u obzir sve podatke koje imate.

Navedite sva ograničenja dokaza i svaku nesigurnost u svojim zaključcima. Koji bi dodatni dokazi bili korisni za procjenu vaše hipoteze?

14. Je li vaša hipoteza o tome koje vrste hrane sadrže protein podržani novim podacima? Objasnite kako dokazi podržavaju ili ne podupiru vašu hipotezu.

Ako vaša hipoteza nije podržana, napišite novu hipotezu koja uzima u obzir sve podatke koje imate.

Navedite sva ograničenja dokaza i svaku nesigurnost u svojim zaključcima. Koji bi dodatni dokazi bili korisni za procjenu vaše hipoteze?


Koordinacija mitofagije i biogeneze mitohondrija tijekom starenja u C. elegans

Poremećaj održavanja mitohondrija u različitim tipovima stanica zajednički je znak mnogih ljudskih patologija i starenja. Nije dobro razumljivo kako se biogeneza mitohondrija usklađuje s uklanjanjem oštećenih ili suvišnih mitohondrija radi održavanja stanične homeostaze. Ovdje pokazujemo da se mitofagija, selektivna vrsta autofagije koja cilja mitohondrije za razgradnju, sučeljava s mitohondrijskom biogenezom kako bi regulirala sadržaj mitohondrija i dugovječnost u Caenorhabditis elegans. Otkrili smo da je DCT-1 ključni posrednik u mitofagiji i osiguranju dugovječnosti u uvjetima stresa kod C. elegans. Oštećenje mitofagije ugrožava otpornost na stres i izaziva mitohondrijsku retrogradnu signalizaciju putem transkripcijskog faktora SKN-1 koji regulira gene biogeneze mitohondrija i mitofagiju pojačavanjem ekspresije DCT-1. Naši nalazi otkrivaju homeostatsku povratnu petlju koja integrira metaboličke signale za koordinaciju biogeneze i prometa mitohondrija. Odvajanje ova dva procesa tijekom starenja doprinosi prekomjernoj proliferaciji oštećenih mitohondrija i padu stanične funkcije.


3.1: Protokol proteina škroba - Biologija

Svi članci koje objavljuje MDPI odmah su dostupni širom svijeta pod licencom otvorenog pristupa. Za ponovno korištenje cijelog ili dijela članka koji je objavio MDPI, uključujući slike i tablice, nije potrebno posebno dopuštenje. Za članke objavljene pod licencom Creative Common CC BY s otvorenim pristupom, bilo koji dio članka može se ponovno koristiti bez dopuštenja pod uvjetom da je izvorni članak jasno citiran.

Značajni radovi predstavljaju najnaprednija istraživanja sa značajnim potencijalom za veliki utjecaj na tom području. Radovi se podnose na pojedinačni poziv ili preporuku znanstvenih urednika i prolaze recenziju prije objavljivanja.

Značajni rad može biti ili izvorni istraživački članak, značajna nova istraživačka studija koja često uključuje nekoliko tehnika ili pristupa, ili opsežan pregledni rad sa sažetim i preciznim ažuriranjima o najnovijem napretku u području koji sustavno pregledava najuzbudljivija dostignuća u znanosti književnost. Ova vrsta rada daje pregled budućih pravaca istraživanja ili mogućih primjena.

Članci o izboru urednika temelje se na preporukama znanstvenih urednika časopisa MDPI iz cijelog svijeta. Urednici odabiru mali broj članaka nedavno objavljenih u časopisu za koje vjeruju da će biti posebno zanimljivi autorima ili važni u ovom području. Cilj je pružiti snimku nekih od najuzbudljivijih radova objavljenih u različitim istraživačkim područjima časopisa.


Priprema uzorka za otkrivanje patogena prenosivih hranom molekularno biološkim metodama

P. Rossmanith, M. Wagner, u Traganje patogenima u prehrambenom lancu, 2011

Diferencijalno centrifugiranje

Diferencijalno centrifugiranje radi postupnim povećanjem brzine centrifugiranja. Niže brzine na početku koriste se za uklanjanje težih čestica hrane iz uzorka, a zatim se brzina povećava sve dok se same mete ne peletiraju. Neiderhauser et al. (1992.) poboljšali su granice detekcije konvencionalnog PCR-a za 1000 puta nakon što su kombinirali dva naredna koraka centrifugiranja upotrebom 100 × g i 3000 × g okretaja. Granice otkrivanja od 10 3 do 10 4 pokazane su za plodove mora i meki sir za nekoliko bakterijskih ciljeva jednostavnim centrifugiranjem u jednom koraku pri brzini od 9000 × g (Wang et al., 1997 ).

Prednosti centrifugiranja su u tome što se brzo, jednostavno i jeftino izvodi nakon što je dostupna odgovarajuća centrifuga. Njegova ograničenja uključuju prianjanje meta na matricu hrane i ko-sedimentaciju meta s česticama hrane, što rezultira neadekvatnim smanjenjem veličine uzorka.


Spurthi 's AP Biology Notebook

Spurthi Tarugu, Kavinmozhi Caldwell, Chelsea Mbakwe, Radha Dave, Navya Kondeti
Sažetak:
Gotovo svi živi organizmi sadrže četiri organska spoja, od kojih su dva lipidi i proteini. Lipidi se sastoje od jedne molekule glicerola i tri molekule masnih kiselina, što rezultira trigliceridom. Masne kiseline čine lipide nepolarnima i ne mogu se otopiti u vodi. Proteini su inherentno važni za svaki živi organizam. Oni upravljaju staničnim procesom, pružaju podršku i transportiraju tvari unutar stanice. Mogu čak imati i oblik enzima i hormona koji reguliraju stanice. Ove važne stanice sastavljene su od polimera aminokiselina čije su funkcionalne skupine karboksilna skupina i slobodna amino skupina. Oba organska spoja doprinose našem životu, a naše zdravlje uvelike ovisi o njima. Znati kako djeluju znači djelomično razumjeti mehaniku ljudskog tijela.

Uvod:

U današnjem medicinskom području provode se testovi za utvrđivanje prisutnosti ili odsutnosti određene tvari, bilo da se radi o proteinima, ugljikohidratima ili lipidima. Ti se testovi provode kako bi se vidjelo ima li navedena osoba potreban broj navedene tvari. Na isti način na koji se testovi rade u laboratoriju kako bi se utvrdila prisutnost ili odsutnost nečega, na isti način smo pristupili laboratoriju za ugljikohidrate i proteine/lipide. Korištenjem pokazatelja utvrdili smo prisutnost ili odsutnost organskih spojeva.

Metode:
Laboratorij za ugljikohidrate:
1. dio (Lugolov test na škrob):
Prvo smo dobili stalak za epruvete i 5 epruveta. Napunili smo svaku epruvetu svakom od sljedećih otopina: glukozom, škrobom, galaktozom, saharozom i destiliranom vodom. Svaka epruveta napunjena je s najmanje 2-3 ml jedne otopine. Svaku smo epruvetu označili imenom otopine koju epruveta sadrži. Nakon toga smo u svaku epruvetu dodali 2-3 ml Lugolove otopine, a zatim je nježno njihali naprijed-natrag kako bismo pomiješali otopine. Na kraju, zabilježili smo bilo kakve promjene boje u našem grafikonu.
Dio 2 (Benediktov test za smanjenje šećera)
Prvo smo dobili stalak za epruvete i 7 epruveta. Njima smo svaku epruvetu označili odgovarajućom oznakom: glukoza, saharoza, maltoza, škrob, riboza, galaktoza i destilirana voda. Zatim smo svaku epruvetu napunili jednom određenom otopinom. Uključili smo ringlu. Zatim smo dobili čašu, napunili je do pola vodom i stavili na ringlu. Nakon što smo posudu stavili na vruću ploču, napunili smo epruvete s oko 2-3 mL Benediktove otopine. Stavili smo sve epruvete u čašu, pomoću stezaljke ili izolirane rukavice, na nekoliko minuta. Uočili smo promjene boje i zabilježili svoja zapažanja u tablici.

Laboratorij za proteine/lipide
Dio 1 (Vizualni test na lipide):
Najprije smo napunili petrijevu zdjelu vodom iz slavine. Zatim smo kapaljkom za kap stavili jednu kap biljnog ulja u Petrijevu zdjelicu. Na kraju smo promatrali biljno ulje u vodi i zabilježili svoja zapažanja.
Dio 2 (Biuretski test za proteine):
Prvo smo dobili stalak za epruvete s 4 epruvete. Svaka epruveta bila je označena oznakama otopina koje su glukoza, škrob, albumin jaja i destilirana voda. Zatim smo stavili 2-3 ml svake otopine u dodijeljenu epruvetu. Nakon toga smo otopine pretvorili u alkalne otopine (pH veći od 7) dodavanjem 2-3 ml 10% -tnog natrijevog hidroksida. Zatim smo u svaku epruvetu dodali nekoliko kapi 1% -tne otopine bakrenog sulfata. Lagano smo ljuljali epruvete naprijed -natrag, miješajući bakreni sulfat s alkalnom otopinom. Na kraju, zabilježili smo bilo kakve promjene boje u našem grafikonu.
3. dio (nepoznato rješenje)
Prvo smo dobili stalak za epruvete i 9 epruveta. Naš učitelj nam je dao tri nepoznata rješenja, A, B i C. Napunili smo 3 epruvete otopinom A, sljedeće 3 otopinom B, a posljednje 3 otopinom C. Prvi set od tri epruvete (A , B i C) infuzirane su kapima Lugolovog joda. Lagano smo protresli ove epruvete i uočili sve promjene boje. Naša zapažanja zabilježili smo u svoj grafikon. Zatim smo uključili ringlu. Na pola puta smo napunili čašu od 500 ml i čekali da se voda zagrije. U sljedećem setu od 3 epruvete (A, B i C), stavili smo u nju nekoliko kapi otopine Benedict ’s, nježno protresli epruvete naprijed -natrag i uronili sve 3 epruvete u kipuću vodu . Nakon nekoliko minuta promatrali smo boju epruveta i zabilježili svoja zapažanja u tablicu. Uzeli smo posljednji set od 3 epruvete (A, B i C) i u nju stavili nekoliko kapi biuretnog reagensa. Lagano smo protresli epruvete i promatrali promjenu boje u epruvetama. Ta smo zapažanja zabilježili u tablicu.

Rezultati
Grafikon 3-1 Rezultati Benediktova testa za smanjenje šećera

Šećeri Talog ili promjena boje Tumačenje
Fruktoza naranča pozitivno za smanjenje šećera
Saharoza plava negativno za smanjenje šećera
Škrob plava negativno za smanjenje šećera
Destilirana voda plava negativno za smanjenje šećera

Grafikon 3-1 Rezultati Lugolovog testa na škrob

Šećeri Talog ili promjena boje Tumačenje
Fruktoza žuta boja negativan na škrob
Saharoza tamno narančasta pozitivan na škrob
Škrob žuta boja negativan na škrob
Destilirana voda žuta boja negativan na škrob

Grafikon 3-5 Rezultati biuret testa na proteine

Šećeri Talog ili promjena boje Tumačenje
Albumin iz jaja Plavo nebo Negativno za proteine
Glukoza Svijetlo plava Negativno za proteine
Škrob Tirkiz Negativno za proteine
Destilirana voda Tamno plava/Deep Purple Pozitivno za proteine

Grafikon 3-6 Ispitivanje sastava uobičajenih tvari

Supstanca ili nepoznata Šećer (Benediktovo testiranje) Lipidi Proteini (testiranje biuretom) Škrob (Lugolovo testiranje)
A Pozitivan Negativan Negativan Negativan
B Negativan Negativan Pozitivan Pozitivan
C Negativan Pozitivan Negativan Negativan

3-1 Ugljikohidrati
Koja je svrha uključivanja cijevi destilirane vode u svako ispitivanje?
Destilirana voda poslužila je kao kontrola za pokus. Pomogao nam je u usporedbi i usporedbi rezultata drugih tekućina u drugim epruvetama s onima iz vode.
Što biste zaključili da je epruveta destilirane vode pokazala pozitivnu reakciju u oba testa?
Da je epruveta destilirane vode pokazala pozitivnu reakciju, zaključio bih da je uzorak kontaminiran.
Što biste učinili u ovom slučaju?
Da je uzorak kontaminiran, riješio bih se kontaminiranog uzorka i od početka započeo ispitivanje destilirane vode.
Što možete zaključiti o razlici u rasporedu ili vezi funkcionalnih skupina adehida ili ketona u glukozi u usporedbi sa saharozom?
Adehid se sastoji od ketona. Uspoređujući razliku u rasporedu ili vezi funkcionalne skupine u glukozi, možemo vidjeti da su adehid i keton vitalne komponente glukoze. S druge strane, te funkcionalne skupine nisu prisutne u saharozi.
Neke biljke skladište hranu kao šećer, dok je druge skladište kao škrob. Predložite test za utvrđivanje zaliha skladištenja za povrće koje biste mogli pronaći na tržnici?
Benedict -ov test za smanjenje šećera i lugolov test za škrob pomoći će odrediti koja se zaliha skladištenja koristi za povrće na tržnici. Ako bi neko povrće pokazalo pozitivnu reakciju na Benedict -ov test, moći ćemo zaključiti da je pohranilo hranu u obliku šećera. Isto vrijedi i za škrobove osim obrnuto. Lugolovim testom mogli bismo utvrditi skladišti li povrće hranu kao škrob.

3-2 Lipidi
U petrijevu zdjelu napola napunjenu vodom iz slavine dodajte jednu kap biljnog ulja, bilo pomoću kapi za oči ili miješanjem vode staklenom šipkom koja je umočena u ulje. Promatrajte što se događa na površini vode i zabilježite svoja zapažanja.
Čestice ulja odbijaju se spojiti s vodom. Zbog gustoće ulja i vode, ulje nastavlja plutati po vodi bez miješanja. Ulje ima manju gustoću od vode. Biljno ulje lako se može razlikovati od vode iz slavine u Petrijevoj zdjelici.
Možda ste ovu reakciju ulja i vode promatrali u svakodnevnom iskustvu. Protumačite svoja zapažanja u smislu strukture molekule biljnog ulja i njene sposobnosti (ili nemogućnosti) da se vodikove veze poveže s vodom.
Biljno ulje se ne miješa s vodom, pa nema sposobnost vodikove veze s vodom. Zbog te činjenice zaključili smo da je biljno ulje nepolarno.
Što možete reći o relativnim gustoćama ulja i vode?
Relativna gustoća ulja je manja od gustoće vode zbog činjenice da ulje pluta na vrhu vode.
U svjetlu vašeg odgovora na prethodno pitanje, koju funkciju osim skladištenja energije masna mrlja služi u kitu?
Masne mrlje u kitu, jer je njegova mast manje gusta od vode, mogu pomoći kitu da pluta. Također, masnoće pomažu izolirati kita.

3-3 Aminokiseline i proteini
Da je tvar dala pozitivan rezultat s reagensom ninhidrina, a negativan rezultat s reagensom Biuret, što biste zaključili o njezinom sastavu?
Ninhidrinski reagens testira aminokiseline, dok biuret testira bjelančevine. Ako je ninidrin test pozitivan, a biuret test negativan, tada se sastav sastoji od aminokiselina.

3-4 Ispitivanje sastava uobičajenih tvari
Koje su tvari bile prisutne u Nepoznatom #1?
U nepoznatom broju 1, šećer je bio jedina prisutna tvar.
Koje su tvari bile prisutne Nepoznato #2?
U nepoznatom #2, škrob i proteini su bili prisutni.

Zaključak
Svrha ovog laboratorija bila je ispitati različite tvari, uključujući fruktozu, saharozu, destiliranu vodu sa škrobom, glukozu i albumin iz jaja na prisutnost ili odsutnost reducirajućih šećera, škroba, šećera, bjelančevina i lipida. U cijelom smo laboratoriju primijetili da je šećerna fruktoza pozitivna na smanjenje šećera, ali negativna na škrob, dok je saharoza negativna i na smanjenje šećera i na škrob. Škrob je bio negativan na smanjenje šećera, škroba i proteina. Škrob bi očito trebao biti pozitivan na škrob, ali naš je test bio negativan pa vjerujemo da je epruveta s oznakom "škrob" sadržavala drugačije rješenje. Također smo saznali da je destilirana voda negativna za smanjenje šećera i škroba, ali pozitivna za proteine. Destilirana voda nije smjela sadržavati proteine, pa smo pretpostavili da je naš uzorak kontaminiran. Još jedna stvar koju smo primijetili je da biljno ulje nije polarno jer nema sposobnost vodikove veze.

Citirana književnost
“LabBench. ” Stranica mosta Prentice Hall. Mreža. 27. rujna 2011.


Označavanje integracije kromatina za mapiranje proteina koji vežu DNA i modifikacije s niskim ulazom

Identitet stanica određuje se selektivnom aktivacijom ili utišavanjem specifičnih gena vezanjem za faktor transkripcije i epigenetskim modifikacijama na genomu. Imunoprecipitacija kromatina (ChIP) standardna je tehnika za mapiranje mjesta vezanja transkripcijskog faktora i modifikacije histona. Nedavno su razvijene alternativne metode ChIP-u za rješavanje rastućih zahtjeva za epigenomskim profiliranjem s niskim ulaganjem. Označavanje integracije kromatina (ChIL) nakon čega slijedi sekvenciranje (ChIL-seq) pokazalo se posebno korisnim za epigenomsko profiliranje uzoraka s niskim unosom ili čak pojedinačnih stanica jer tehnika pojačava ciljani genomski slijed prije lize stanica. Nakon označavanja ciljnog proteina ili modifikacije in situ s protutijelom konjugiranim s oligonukleotidom (ChIL sonda), obližnja sekvenca genoma pojačana je transpozicijom posredovanom Tn5 transpozazom, a zatim T7 RNA polimerazom posredovanom transkripcijom. ChIL-seq omogućuje otkrivanje lokalizacije ciljanog antitijela pod fluorescentnim mikroskopom i na genomskoj razini. Ovdje opisujemo detaljni protokol ChIL-seq s metodama procjene za ključne korake, uključujući reakciju ChIL sonde, transpoziciju, in situ transkripciju i pripremu biblioteke za sekvenciranje. Protokolu obično treba 3 dana za pripremu biblioteke za sekvenciranje, uključujući inkubacije preko noći za reakciju ChIL sonde i in situ transkripciju. Sonda ChIL može se zasebno pripremiti i pohraniti nekoliko mjeseci, a njezini protokoli pripreme i evaluacije također su detaljno dokumentirani. Također je opisana izborna analiza za više ciljeva (multitarget ChIL-seq). Očekujemo da će ovdje predstavljeni protokol učiniti ChIL tehniku ​​široko dostupnom za analizu dragocjenih uzoraka i olakšati daljnju primjenu.


Biokemija. 5. izdanje.

Proteini su najsvestranije makromolekule u živim sustavima i služe ključnim funkcijama u biti svih bioloških procesa. Funkcioniraju kao katalizatori, transportiraju i skladište druge molekule poput kisika, pružaju mehaničku potporu i imunološku zaštitu, stvaraju kretanje, prenose živčane impulse te kontroliraju rast i diferencijaciju. Doista, velik dio ovog teksta bit će usredotočen na razumijevanje što proteini rade i kako obavljaju te funkcije.

Nekoliko ključnih svojstava omogućuje proteinima sudjelovanje u tako širokom rasponu funkcija.

Proteini su linearni polimeri izgrađeni od monomernih jedinica koje se zovu aminokiseline. Konstrukcija velikog niza makromolekula od ograničenog broja monomernih građevnih blokova ponavlja se tema u biokemiji. Ovisi li funkcija proteina o linearnom slijedu aminokiselina? Funkcija proteina izravno ovisi o njegovoj trodimenzionalnoj strukturi (slika 3.1). Izvanredno, proteini se spontano presavijaju u trodimenzionalne strukture koje su određene redoslijedom aminokiselina u polimeru proteina. Tako, proteini su utjelovljenje prijelaza iz jednodimenzionalnog svijeta sekvenci u trodimenzionalni svijet molekula sposobnih za različite aktivnosti.

Proteini sadrže širok raspon funkcionalnih skupina. Ove funkcionalne skupine uključuju alkohole, tiole, tioetere, karboksilne kiseline, karboksamide i razne osnovne skupine. Kada se kombiniraju u različitim sekvencama, ovaj niz funkcionalnih skupina čini širok spektar funkcije proteina. Na primjer, kemijska reaktivnost povezana s tim skupinama bitna je za funkciju enzimi, proteini koji kataliziraju određene kemijske reakcije u biološkim sustavima (vidi poglavlja 8 �).

Bjelančevine mogu međusobno djelovati i s drugim biološkim makromolekulima i stvarati složene cjeline. Proteini unutar ovih sklopova mogu djelovati sinergijski kako bi stvorili sposobnosti koje nemaju pojedinačne komponente proteina (slika 3.2). Ti sklopovi uključuju makro-molekularne strojeve koji provode točnu replikaciju DNA, prijenos signala unutar stanica i mnoge druge bitne procese.

Neki proteini su prilično kruti, dok drugi pokazuju ograničenu fleksibilnost. Krute jedinice mogu funkcionirati kao strukturni elementi u citoskeletu (unutarnja skela unutar stanica) ili u vezivnom tkivu. Dijelovi proteina s ograničenom fleksibilnošću mogu djelovati kao šarke, opruge i poluge koji su ključni za funkciju proteina, za sastavljanje proteina međusobno i s drugim molekulama u složene jedinice te za prijenos informacija unutar i između stanica (slika 3.3).

Lik

Kristali humanog inzulina. Inzulin je proteinski hormon, ključan za održavanje šećera u krvi na odgovarajućoj razini. (Dolje) Lanci aminokiselina u određenom slijedu (primarna struktura) definiraju protein poput inzulina. Ti se lanci presavijaju u dobro definirane (više.)

Slika 3.1

Struktura diktira funkciju. Proteinska komponenta stroja za replikaciju DNA okružuje dio dvostruke spirale DNA. Struktura proteina omogućuje kopiranje velikih segmenata DNA bez odvajanja stroja replikacije od (više.)

Slika 3.2

Složena skupina proteina. Elektronska mikrografija snimljenog tkiva insekata u presjeku prikazuje heksagonalni niz od dvije vrste proteinskih niti. [Ljubaznošću dr. Michaela Reedyja.]

Slika 3.3

Fleksibilnost i funkcija. Nakon vezanja željeza, protein laktoferin prolazi kroz konformacijske promjene koje omogućuju drugim molekulama da razlikuju oblike bez željeza i oblike vezane za željezo.

  • 3.1. Proteini se grade iz repertoara 20 aminokiselina
  • 3.2. Primarna struktura: Aminokiseline su povezane peptidnim vezama u oblik polipeptidnih lanaca
  • 3.3. Sekundarna struktura: Polipeptidni lanci mogu se presavijati u pravilne strukture, poput alfa heliksa, beta lista i okretaja i petlji
  • 3.4. Tercijarna struktura: Proteini topljivi u vodi presavijeni u kompaktne strukture s nepolarnim jezgrama
  • 3.5. Kvartarna struktura: Polipeptidni lanci mogu se sastaviti u višejedinice
  • 3.6. Aminokiselinski niz proteina određuje njegovu trodimenzionalnu strukturu
  • Sažetak
  • Dodatak: Pojmovi na bazi kiseline
  • Problemi
  • Odabrana čitanja

U dogovoru s izdavačem, ovoj je knjizi dostupna značajka pretraživanja, ali je nije moguće pregledavati.


Amilaza u Laboratoriju za škrob

U ovom ćete pokusu promatrati djelovanje enzima amilaze na škrobu. Amilaza mijenja škrob u jednostavniji oblik: šećer maltoza, koji je topljiv u vodi. Amilaza je prisutna u našoj slini, a počinje djelovati na škrob u hrani dok je još u ustima.
Izloženost toplini ili ekstremnom pH (kiselina ili baza) će denaturirati bjelančevine. Enzimi, uključujući amilaze, su proteini. Ako se denaturira, enzim više ne može djelovati kao katalizator reakcije.
Benediktova rješenja je testni reagens koji pozitivno reagira s jednostavnim reducirajućim šećerima poput maltoze, ali neće reagirati sa škrobom. Pozitivan test uočen je pri stvaranju taloga smeđecrvene boje bakrovog oksida. Slabiji pozitivan test bit će žuta do narančasta.

Dodati 1g kukuruznog škroba u čašu koja sadrži 100 ml hladne destilirane vode. Uz često miješanje zagrijavajte smjesu samo dok ne počne ključati. Pustite da se ohladi.

1. Čašu od 250 mL napunite s približno 3/4 vode i stavite na vruću ploču radi kupanje s kipućom vodom. Držite vodu SAMO NA VRIJENJU.

2. Označite 3 epruvete A, B i C. “Pljunite ” između 1 i 2 ml sline u svaku epruvetu.

3. U cijev A, dodati 2 ml octa. U cijevi B i C, dodati 2 ml destilirane vode. Lupkajte epruvete za miješanje.

4. Postavite cijev B u kipuću vodenu kupelj za 5 minuta. Nakon pet minuta izvadite iz kade i vratite u stalak za epruvete.

5. Dodati 5 ml otopine škroba u svaku epruvetu i lupati da se pomiješa. Ostavite epruvete da sjednu 10 minuta, povremeno lupajući cijevima za miješanje.

6. Dodati 5 ml otopine Benedikta ’s u svaku epruvetu i lupanjem pomiješati. Epruvete stavite u kupelj s toplom vodom. Za početak reakcije potrebno je nekoliko minuta.

Cijev A: Škrob + slina tretirana octom (kiselinom)

Što to ukazuje? __________________________________________________

Cijev B: Škrob + slina i voda, obrađeno u kipućoj vodenoj kupelji

Što to ukazuje? __________________________________________________

Cijev C: Škrob + slina

Što to ukazuje? __________________________________________________

1. Koja je funkcija enzima?

2. Gdje se supstrat veže za enzim?

3. Ako je u reakciji prisutan enzim, potrebno je manje ________________ _________________ za početak reakcije.

4. Koji se uobičajeni sufiks nalazi na kraju većine bioloških enzima?

5. Većina enzima su makromolekule zvane ________________.

6. Definirajte denaturaciju proteina.

7. Navedi 3 stvari koje mogu denaturirati ili razviti enzim.

8. Koja slaba kiselina je u ovom laboratoriju denaturirala protein?

9. Koja je svrha stavljanja jedne epruvete u kupelj s toplom vodom?


Gledaj video: Mise en évidence des glucides,lipides et protides (Svibanj 2022).